孫干卿是山東臨淄人,1919年1月出生,1938年初參加八路軍,同年加入中國共產黨,曾任八路軍山東縱隊戰士、班、排、連、營長。
抗日戰爭勝利后,孫干卿隨解放大軍北上,改編為東北民主聯軍,先后任東北野戰軍團長,第四野戰軍師參謀長,參加了四平保衛戰和臨江、遼沈、平津、解放海南島等戰役。
中華人民共和國成立后,孫干卿歷任副師長、師長、軍參謀長,廣州軍區炮兵司令員,海南軍區司令員,廣州軍區參謀長,昆明軍區參謀長、司令部顧問。
孫干卿于1961年晉升為少將,曾獲二級獨立自由勛章、二級解放勛章,1984年9月離職休養。
1984年,孫干卿參與指揮邊境自衛還擊作戰。那時他已65歲高齡,親率偵察分隊,翻山越嶺查看地形,親手擬定作戰方案,果斷調整部署炮兵部隊,為確保作戰勝利立了大功。